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关于景德镇市第二人民医院基于16SrDNA测序及代谢组学技术的样本微生态特征与功能代谢分析服务的技术方案征

23小时前招标公告-公告公开招标江西 - 景德镇市 关注

基本信息

省份/直辖市 江西 所属地区 景德镇市
采购单位 景德镇市第二人民医院 项目联系方式
更多联系方式 高科长 138****0922 余先生 138****8775 180****6912 更多联系方式(11个)
以上信息为大数据平台自动计算结果,如有误差以正文为准

正文

各有关供应商:

根据医院工作要求,现对以下项目进行公开征询。本次公开征询情况将作为采购人编制采购文件最高限价、主要技术指标及方案的参考依据,欢迎广大符合要求的生产企业及经营企业积极参与。现将有关事项公告如下:

一、采购项目及要求:

项目名称:基于16S rDNA测序及代谢组学技术的样本微生态特征与功能代谢分析服务

详细需求内容见附件。

二、报名时间及地点

1.时间:本公告发布之日起5个工作日内,上午8:00-11:30,下午2:30-5:00

2.地点:景德镇市第二人民医院采购科(****大楼****楼

3.报名方式:现场递交和邮寄。

三、报名资料要求,参与报名的供应商须携带以下资料(加盖公章):

1.报价单(格式自拟,需提供项目实施方案和报价明细及总价);

2.法定代表人授权委托书(附法定代表人及被授权人身份证复印件);

3.有效的营业执照副本复印件;

4.相关资质证书及类似业绩;

5.承诺函(格式自拟),须包含以下内容:我公司本着诚实守信的原则参与本次市场调研报价,郑重承诺:我公司与参与本次调研报价的其他公司之间不存在关联关系,且与贵院本项目相关工作人员之间不存在任何利害关系。如有虚假,愿承担由此产生的一切法律责任及后果。

四、联系方式

联系人:吴老师8223708

五、特别说明

本次市场调研仅作为项目采购前的市场信息参考,不作为正式采购的中标承诺。

附件:技术服务内容要求

一、项目名称

基于16S rDNA测序及代谢组学技术的样本微生态特征与功能代谢分析服务

二、服务内容概述

拟委托专业生物技术服务机构开展样本微生物群落结构解析及代谢功能研究,通过16S rDNA扩增子测序技术结合代谢组学检测与多组学关联分析,系统分析样本中微生物组成、群落结构变化及代谢产物特征,挖掘微生物与代谢功能之间的潜在关联。

服务内容包括样本检测、数据分析、生物信息学分析、代谢物检测及综合数据解读,并提供完整分析报告及原始数据。

三、16S rDNA测序服务内容

1. 样本处理及测序服务

服务方负责:样本接收、质量检测及实验前处理;微生物总DNA提取;DNA质量检测(浓度、纯度、完整性评估);细菌16S rDNA特定区域PCR扩增;扩增产物纯化及文库构建;***平台测序。

2. 16S rDNA测序数据分析内容

(1)测序数据质控

包括:原始测序数据质量评估;低质量序列过滤;接头序列去除;序列拼接及优化;OTU/ASV聚类分析;物种注释。

(2)微生物群落结构分析

分析内容包括:微生物分类学组成分析;门(Phylum)、纲(Class)、目(Order)、科(Family)、属(Genus)、种(Species)水平物种组成分析;优势菌群分析;样本间微生物组成差异比较。

(3)多样性分析

包括:Alpha多样性分析(Shannon指数;Simpson指数;Chao1丰富度指数;ACE指数;群落丰富度及均匀度评价),Beta多样性分析(PCA分析;PCoA分析;NMDS分析;UPGMA聚类分析;样本间群落结构差异评价)。

(4)差异菌群分析

包括:LEfSe分析;LDA效应分析;差异物种筛选;关键菌群标志物挖掘。

(5)微生物功能预测分析

包括:PICRUSt2功能预测;KEGG代谢通路预测;微生物功能基因丰度分析;代谢功能潜力分析。

四、代谢组学检测服务内容

1. 代谢物检测

采用非靶向代谢组学技术,对样本中的小分子代谢物进行系统检测。

服务内容包括:样本前处理;代谢物提取;LC-MS/MS或GC-MS检测;代谢物定性及定量分析;数据质量控制。

2. 代谢组学数据分析

(1)数据预处理(包括:原始数据质量控制;峰识别;峰面积积分;数据标准化;数据过滤及归一化处理。

(2)代谢物鉴定(包括:代谢物数据库匹配;化合物注释;差异代谢物筛选)。

(3)统计分析(包括:PCA主成分分析;PLS-DA分析;OPLS-DA分析;聚类分析;热图分析)。

(4)差异代谢物分析(包括:差异代谢物筛选;VIP值分析;Fold Change分析;火山图展示;代谢物变化趋势分析)。

(5)代谢通路分析(包括:KEGG代谢通路富集分析;***网络分析;关键代谢通路挖掘;生物学功能解释)。

五、16S rDNA与代谢组联合分析服务

结合微生物组数据与代谢组数据开展多组学关联分析。

主要包括:

1. 微生物-代谢物关联分析(分析:核心菌群与差异代谢物相关关系;Spearman相关性分析;***网络构建)。

2. 综合功能分析(包括:微生物群落变化与代谢变化联合解释;关键菌群筛选;关键代谢物筛选;潜在功能通路分析)。

3. 可视化展示(提供:相关性热图;网络关系图;代谢通路图;多组学联合分析图)。

六、服务交付内容

服务方需提供:项目实验方案;样本检测报告;16S rDNA测序原始数据;测序质量控制报告;微生物群落分析报告;代谢组检测原始数据;代谢组学分析报告;多组学联合分析报告;数据分析结果图表;项目技术总结报告。

七、技术服务要求

服务机构应具备:微生物组测序技术能力;***平台;LC-MS/MS代谢组检测能力;多组学生物信息分析能力;项目经验及规范化数据交付能力。

八、预期研究目标

通过16S rDNA测序及代谢组学联合分析:明确样本微生物群落组成及结构变化;筛选关键差异菌群;分析代谢产物变化特征;解析微生物与代谢功能之间的关联机制;为后续机制研究及成果发表提供数据支持。

公众号

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本公告地址:https://www.bid110.com/view/7779/tUbCraABni4p5U9XGAZe.html

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